淀川に至る第１疏水が完成したことにより、大津から京都を経て大阪までの舟運が開きました。これにより、米・炭・木材・石材などを舟で運搬できるようになり、物流が拡大したため、経済と産業のさらなる発展に繋がりました。

また、運輸に加え、観光客を乗せた遊覧船が多く行き交う名所としても脚光を浴びることになりました。

琵琶湖疏水の水は、京都御所や東本願寺などの施設を守る防火用水としても活用されました。蹴上の疏水沿いに建つ旧御所水道ポンプ室は、かつて京都御所を火災から守るための施設として使われ、今でもその重厚感ある意匠を見ることができます。（国指定登録有形文化財）